Dentro del conjunto del patrimonio documental, los archivos familiares son básicos para el conocimiento de la sociedad, de la historia y de la antropología social. 

El Archivo que atesora la Casa Museo Cayetano Gómez Felipe reúne principalmente los fondos documentales de una familia relativos a sus asuntos privados y a la administración de sus bienes. Gracias al interés del coleccionista, este archivo cuenta también con otros documentos «externos» que nos aportan información tanto en la vertiente histórica como en la gráfica y visual, principalmente de la isla de La Palma y, en menor medida, de Tenerife. La parte más importante, en cuanto a volumen, corresponde a los siglos XVIII, XIX y principios del XX. 

Los fondos documentales están formados –como ocurre siempre en un archivo de carácter eminentemente familiar– por la documentación generada por un tronco común, en este caso el de los Gómez Felipe, el cual se va ensanchando con la entrada de material de las familias con las que enlaza. Está compuesto en gran parte por documentos conservados a lo largo de los siglos y que Cayetano se encargó «formalmente» de custodiar. Aunque el coleccionista no llegó a hacer una clasificación por temática, cronología o tipología, sí hemos podido apreciar que fue prudente y, ante el miedo de que estos pudieran dispersarse o perderse, algunos documentos aparecen clasificados. 

Dentro de la documentación familiar se incluye todo aquello referido a asuntos de índole personal: acontecimientos como bautizos, matrimonios, defunciones y entierros, correspondencia, documentación sobre el Patrimonio y la transmisión de bienes (registros de escrituras notariales, compraventas, arrendamientos, poderes, inventarios de bienes, testamentos, hijuelas, etc.), además de documentación genealógica. También es interesante resaltar la documentación literaria (obras de teatro, poemas), libretas que aparecen clasificadas como «retazos históricos» o efemérides, recetas de cocina, etc. 

A la documentación que forma parte del Archivo de Cayetano se suma el archivo de su hermano Antonio Gómez Felipe y el Fondo Cosmelli Sotomayor, el cual Cayetano obtuvo a través de Doña Rosario Becerra Cosmelli (1865-1943), amiga personal del coleccionista.